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As mensagens HL7 são constituídas por segmentos e esses segmentos são constituídos por campos. Os segmentos são sempre iniciados com um código de três dígitos que identifica o tipo de segmento e consequentemente os campos que compõem esse segmento. Todas as mensagens HL7 começam obrigatoriamente com o segmento /wiki/spaces/PD/pages/32276579 MSH que corresponde ao Header da mensagem e contém no campo /wiki/spaces/PD/pages/32276579 MSH -9 o código identificador do tipo da mensagem que vai ser enviada. Neste segmento é também passada a informação acerca das aplicações e instituições de origem e destino da mensagem. Os campos /wiki/spaces/PD/pages/32276579 MSH-3 e /wiki/spaces/PD/pages/32276579 MSH-5 correspondem às aplicações de origem e destino respectivamente. Os campos /wiki/spaces/PD/pages/32276579 MSH -4 e /wiki/spaces/PD/pages/32276579 MSH -6 correspondem às instituições de origem e destino respectivamente.
Os segmentos que seguem o MSH /wiki/spaces/PD/pages/32276579devem corresponder aos necessários da mensagem indicada no Header, campo /wiki/spaces/PD/pages/32276579 MSH-9, cada mensagem tem diferentes campos obrigatórios.
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